Oi @lucas-ferreira, tudo bem?
No caso de troubleshooting o recomendado é mover as máquinas que precisam ser analisadas para um Virtual Group distinto e então realizar os testes necessários. Nesse cenário, recomendaria desabilitar as blades que você entende que podem estar impactando, somente nesse Virtual Group, para validar.
Dessa maneira não seria necessário desinstalar o agente por completo. Porém, caso queira, também é possível fazer a desinstalação através de um push operation. Para isso, navegue até "Push Operations" >> "Add" >> "Agent Settings" >> "Uninstall Client" e selecione a máquina desejada.
Att,
Henrique